Snæblen har gennem årene været udsat for en række trusler der har resulteret i at arten er gået stærkt tilbage. I dag er snæblen totalfredet og opført som en sjælden og national ansvarsart på den danske rødliste 1997.
Spærringer
I modsætning til laks og ørred er snæblen hverken i stand til at springe ret højt eller til at svømme igennem fisketrapper. Derfor må der ikke være spærringer i vandløbene som f.eks. ved dambrug og vandkraftværker – snæblen kræver fuldstændig fri adgang til gydepladserne i vandløbene.
Regulering
Snæblen gyder på vandløbsstrækninger, der slynger sig naturligt og har god vandkvalitet med rent vand. Desuden skal der være flerårige vandplanter og grus. Regulering og udretning af vandløbene, ofte fulgt op af en hårdhændet vedligeholdelse, har ødelagt mange gydeområder og opvækstområder for ynglen.
Forurening
Forurening medfører bl.a. at æggene ikke kan udvikle sig og kvæles.
Dræning
Efter klækningen kræver yngelen store fladvandede arealer i de nederste dele af vandløbet. Der vokser den op de første par måneder, inden den vandrer ud i det salte Vadehav.
Men udretninger af vandløbene, og dræning af enge der ellers bliver oversvømmede, betyder, at der ikke er nok steder for yngelen at opholde sig. Yngelen bliver bogstaveligt talt skyllet ud i det salte hav for tidligt - og dør.
Spærringer for ynglen
Endvidere hindrer vandindtag ved bl.a. dambrug ynglen i at vandre ud i Vadehavet - eller de bliver ført ind i dammene, hvor dambrugsfiskene æder dem.
Fiskeri
Fiskeri, både lyst-, fritids- og erhvervsfiskeri, medfører at flere snæbler ender som "bifangst" - selvom arten er totalfredet.